借助 KAPA 接头和配件提升准确性和通量
对于新一代测序(NGS),使用带索引的接头对样本进行条形码标记可显著提高效率。这一过程被称为多重测序,它允许将多个样本池化到单次测序运行中,随后通过生物信息学手段对生成的测序读段进行分拣。
然而,部分高通量测序仪容易出现索引错配(索引跳跃)现象,这可能会降低数据质量。独特的双索引(UDI)策略有助于减轻此类事件的影响。
罗氏提供两种类型的 KAPA 接头:
全长接头:适用于无 PCR 样本制备,最多支持 96 种索引组合
KAPA UDI 接头
优势一览
较低的错误分配率提高了结果的可靠性
在多重测序过程中,索引错配可能由多种因素导致,包括:
索引跳跃
条形码或样本的交叉污染
混合样本在PCR扩增过程中的模板切换
测序或分析错误
其中部分问题可通过精心设计的适配器及严格的质量控制来缓解。
KAPA UDI 接头旨在通过以下方式确保结果的可靠性:
独特的双索引组合,可在数据分析前过滤掉具有意外条形码组合的测序读段
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