概述KAPA RNA EvoPrep 试剂盒为新一代测序(NGS)提供简化的 RNA 文库构建工作流程。基于 KAPA RNA HyperPrep Kit 系列,EvoPrep 将输入 RNA 转换为已连接接头的测序文库,步骤更少,操作时间更短。本产品仅用于研究(RUO),不可用于诊断用途。
KAPA RNA EvoPrep 用于 RNA 文库构建- 快速流程:约 3.5 小时,操作时间最少
- 灵敏:可检测更多独特转录本,包括低输入和劣化(FFPE)RNA
- 可靠:不同输入量之间高度一致,结果可重复
主要优点与亮点- 简化的流程可减少操作时间、试剂用量和塑料耗材
- 提高文库转化率,在广泛输入范围内获得更高产率
- 增加独特分子的捕获(提高映射唯一率、降低重复率与接头二聚体比例)
- 适合自动化:兼容液体处理自动化和 Roche AVENIO Edge 系统工作流程
- 包含改良的连接化学(KAPA EvoT4 DNA ligase)以及用于扩增的 KAPA HiFi HotStart DNA Polymerase,以实现低偏倚、高保真度的 PCR
性能与灵敏度与早期的 KAPA RNA HyperPrep Kits 及多种竞争产品相比,本系列在性能上有所提升:在低质量 FFPET 输入以及从低量(5 ng)到较高输入(至推荐上限)时可检测到更多基因与转录本。页面数据显示:在低质量 FFPET 样本中检测到的基因数量增加、映射唯一率提高、重复率下降以及接头二聚体比例降低。
工作流程概要- 可选的前处理富集:mRNA 捕获(poly(A) oligo-dT 磁珠)或 rRNA 和/或 球蛋白(globin)去除(与互补 DNA 寡核苷酸杂交,随后进行 RNase H/DNase 处理)
- RNA 片段化(加热 + 镁离子)
- 通过随机引物进行第一链 cDNA 合成
- 二链合成与 A-tail 合并(在第二链中掺入 dUTP 以实现链特异性)
- 接头连接(TA 连接到 A-tailed 片段)
- 使用高保真聚合酶进行文库扩增(标记为 dUTP 的链不被扩增,以保留链特异性)
兼容性与推荐输入量表格(产品变体与典型输入):
Product variant — Typical reactions — EAN
KAPA RNA EvoPrep (24rxn) — 24 reactions — 07613336240564
KAPA RNA EvoPrep (96rxn) — 96 reactions — 07613336240557
KAPA RNA EvoPrep Kit (384rxn) — 384 reactions — 07613336239308
KAPA mRNA EvoPrep (24rxn) — 24 reactions — 07613336239377
KAPA mRNA EvoPrep (96rxn) — 96 reactions — 07613336239384
KAPA RNA EvoPrep+RiboErase HMR (24rxn) — 24 reactions — 07613336239315
KAPA RNA EvoPrep+RiboErase HMR (96rxn) — 96 reactions — 07613336239322
KAPA RNA EvoPrep+RiboErase HMR (384rxn) — 384 reactions — 07613336239339
KAPA RNA EvoPrep+RiboErase Globin (96rxn) — 96 reactions — 07613336239353
KAPA RNA EvoPrep+RiboErase Globin (384rxn) — 384 reactions — 07613336239360
关于输入量和样本类型的说明:推荐的输入范围因试剂盒变体而异(示例范围包括某些 RNA EvoPrep 试剂盒为 0.25 ng–100 ng,其他为 5 ng–1 µg 或 25 ng–1 µg)。KAPA mRNA EvoPrep 适用于高质量 RNA(RIN ≥ 7)和 poly(A) 选择流程;带 RiboErase (HMR) / Globin 的试剂盒用于人/小鼠/大鼠去除,并在使用适当输入量和协议调整时与低质量 FFPE RNA 兼容。
储存与处理典型储存建议:对温度敏感的组分(cDNA 合成和文库制备试剂)应存放于 –15°C 至 –25°C;某些前处理富集组分(例如 mRNA 捕获)存放于 2°C–8°C;KAPA HyperPure Beads 存放于 2°C–8°C。请遵循使用说明书以获取准确的储存与处理说明以及协议中推荐的可安全中断点。
法规/使用说明仅供研究使用。不用于诊断程序。
规格 / 技术参数- 产品系列:KAPA RNA EvoPrep
- 主要应用:用于 NGS 的 RNA 文库构建(全转录组、基因表达、剪接位点、基因融合、lncRNA)
- 富集选项:无富集(总 RNA)、mRNA 捕获(poly(A))、rRNA 和/或 球蛋白去除(HMR/Globin)
- 输入范围(按试剂盒示例):0.25 ng–100 ng;5 ng–1 µg;25 ng–1 µg(取决于具体试剂盒)
- 文库制备时间(典型):约 3.5 小时(简化流程)
- 片段化:加热 + 镁,针对输入质量可调
- 链特异性:是(在第二链中掺入 dUTP;实现链特异性测序)
- 连接化学:KAPA EvoT4 DNA ligase
- 扩增聚合酶:KAPA HiFi HotStart DNA Polymerase
- 磁珠纯化:提供 KAPA HyperPure Beads 以进行纯化步骤
- 自动化:兼容液体处理自动化和 Roche AVENIO Edge 系统
- 物种兼容性:KAPA RNA EvoPrep(无前处理)— 广泛(真核、生物、植物等);带 RiboErase (HMR)/Globin 的试剂盒 — 适用于人、小鼠、鼠的去除寡核苷酸
- 典型优势:灵敏度提高(更多独特转录本)、映射唯一率更高、重复率和接头二聚体更低、减少试剂和纯化步骤