KAPA HyperPETE 工作流程是一种新型的混合捕获技术,旨在利用引物延伸反应,特异性地捕获并释放目标文库分子以供测序。
KAPA HyperPETE 产品目录面板包含现成的固定设计面板,适用于泛癌变异(含 MSI 模块)、肿瘤热点、遗传性肿瘤、肺癌融合变异以及新生儿筛查。这些固定设计面板凝聚了十余年的探针设计经验。
优势一览
专为从难以处理的样本类型中挖掘关键基因组信息而开发
组织 RNA(FFPET)
可在广泛的 FFPET RNA 输入量范围内实现高度特异性的富集(图 1)
可检测参考细胞系样本中存在的所有融合基因 (表 1)
血浆 cfDNA
在多种 cfDNA 输入量范围内,均能实现高目标读取率和高的外显子覆盖率(≥1000X)(图 2)
从多种血浆 cfDNA 输入量中以高灵敏度检测变异
使用 FFPE RNA 配合 KAPA HyperPETE LC 融合基因检测面板时的性能表现。
KAPA HyperPETE 肺癌融合基因检测面板在测试的所有 FFPE 样本中,无论输入量为 10 ng 还是 50 ng,靶向读取率均达到 92%–97%。
无论使用10 ng还是50 ng不同质量(低、中、高)的FFPE RNA作为输入样本,高靶向读取率均证明了该检测的高特异性。 靶向读取率为 92% 至 97%(包括管家基因和融合靶标),在所有样本输入量、质量和类型下均表现良好。靶向读取率是在去除 rRNA 读取(占所有读取量的 0.8% 至 11%)后计算得出的。 使用两(2)份细胞系样本(重复测定)和十四(14)份正常邻近FFPET样本来评估性能。
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