相关技术,将样品序列痕迹与参考痕迹进行物理比较,用Phred 20双向序列提供高达99.5%的准确性,灵敏度为主峰的5%。
从桑格测序痕迹分析DNA变异的独特工具
Mutation Surveyor®软件是一个强大而准确的DNA测序分析工具,适用于由以下电泳系统产生的Sanger测序文件:
应用生物系统公司的遗传分析仪
贝克曼CEQ
Promega Spectrum Compact CE系统
Mutation Surveyor能够在15分钟内对多达2000个Sanger测序文件(.ab1, .RSD, .ESD & .scf)进行变异分析,在分析DNA变异时具有出色的准确性、敏感性和低假阳性和假阴性率,包括:
单核苷酸多态性(SNPs)
同型插入和缺失(indels)。
去卷积和检测杂合子的缩略词
直接测序中的体细胞突变。
Mutation Surveyor软件包包括专利的反相关技术(美国专利8,086,410),该技术将样本序列轨迹与参考轨迹进行物理比较,用Phred 20双向序列提供高达99.5%的准确性,灵敏度为主峰的5%。
在提高准确性和灵敏度的同时,Mutation Surveyor软件具有许多工具:
自定义报告
自动下载有注释的GenBank参考文件
DNA甲基化检测
线粒体DNA序列分析
等位基因定量
变异体知识数据库
Mutation Surveyor软件包括旨在增强和优化Sanger测序痕迹中变体发现过程的功能。
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