为 Nexus 集成 Nexus
DB 构建的可搜索参考数据是一个宝贵的资源,并包含在所有 Nexus 副本号订阅中。
功能和优势
存储您自己的数据
作为 Nexus 用户,您可以使用 NexusDB 私下存储您自己的数据。 使用亚马逊的 AWS 平台在场外保护数据。
通过基因或感兴趣区域的参考数据查询,快速查找样本和临床注释,能够比较不同的 ACGH、SNP 阵列和 NGS 平台生成的数据。
Nexus DB 中的参考数据
能够与您选择的人员轻松共享您自己的数据,并在全球范围内进行协作。
在 Nexus DB
宪法遗传学
AGRE 可用数据 — 自闭症遗传研究交流. HG18 和 HG19 基因组中可用的所有数据都构建。
ISCA/ICCG (DBVar) — 基因组变异的结构变异 (SV) 数据库,其中包含一系列宪法遗传疾病的临床注释。
Affymetrix CytoScana 高清参考项目 — 375 个普通样本用于创建 CytoScana HD 参考文件
CGA Premier — 重新处理和手动策划的 TCGA 数据,从而显著提高保真度并相应减少假阳性呼叫。
数据集包括急性髓系白血病、胶质母细胞瘤 (GBM)、卵巢浆性囊肿腺癌、肾脏透明细胞癌、结肠腺癌、肺鳞癌等。
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