数据分析软件 TCGA Premier

临床用于测序肿瘤科

策划 CNV, 序列变体, 简化访问. 癌症基因组图集 (TCGA) 是一个惊人的资源，它不断增长，包含了 30 多种癌症类型接近 12,000 个肿瘤的基因组特征。 通过重新分析数据并由训练有素的科学家手动整理每个样本的结果，TCGA Premier 数据库具有来自这一丰富资源的最高保真度拷贝号信息。 特点和优 点由专家策划 开始与通过特殊访问可用的原始数据, 我们已经配对肿瘤与他们匹配的正常去除生殖系多态性. 然后，专家科学家查看每个样本的基因组剖面图，校正基线倍率和分割，并手动调用复制中性纯合分段 (LOH) 和镶嵌阈值边界上的事件。 集成序列变异 通过全外表组测序获得的序列变异与 CNV 集成，提供更全面的基因组图像。 完全注释的数据集 数据集全面注释了特定样本的审查者评论，调用所使用的参数设置、其他样本特定信息以及详细的临床注释，如生存率、肿瘤级别等，以促进进一步分析。 为什么 TCGA 总理？ 对于更广泛的研究有用 处理 GSIDSY 样本生成的结果适用于整个人群的剖面图，但使单个样本过度分割，许多样本具有不正确的倍率。 通过纠正这些并整合序列变异，我们已经使数据集变得更有用于诸如生存分析或肿瘤亚型分析等研究。