概述SimpleSlideInterface 是一款类 REST 的 API 与软件接口,为数字病理切片、注释和元数据提供结构化的编程访问。它将 3DHISTECH 解决方案(SlideCenter、SlideStorageDX)与本地存储库和第三方系统集成,以支持自动化图像分析、AI 工作流、高通量研究和多用户临床协作。
功能- 高效的切片访问:从本地存储、SlideCenter 和 SlideStorageDX 检索、打开和查询切片。
- 切片元数据获取:提取尺寸、分辨率、通道和扫描映射等属性。
- 高级瓷砖/图像处理:根据坐标、放大倍数和焦点索引读取特定瓷砖或区域。
- 注释管理:基于 GeoJSON 的注释读取/插入/删除;支持 TMA 标记处理。
- 原始视野(FOV)访问:检索相机原始 FOV 数据(需授权)。
- 搜索与筛选:在本地和远程存储库中执行文件夹与切片搜索。
- 开发者支持:类 REST API,提供 Python 示例和 Jupyter Notebook 集成,便于快速原型开发。
主要特性(高级)- 用于切片访问与操作的类 REST API。
- 提供 Python 示例和 Jupyter Notebook 支持。
- 高效的瓷砖检索与选择性区域读取。
- 适用于研究与临床部署的安全集成选项。
产品版本与许可- SimpleSlideInterface (Research Version):面向研究的版本,核心功能可免费使用;本地访问吞吐量有限,可通过授权获得本地无限访问和更快的瓷砖检索。
- SimpleSlideInterface DX (Integration Version):面向临床/诊断系统的集成版,SlideStorageDX 的完整访问为授权功能,提供不检索患者数据的安全图像访问。
- 免费版限制:仅允许单实例运行;本地切片访问受限;瓷砖检索速度上限为 1000 瓷砖/秒(64 兆像素/秒)。
附加功能- 打开切片时对图像和属性数据进行切片级缓存。
- 支持 GeoJSON 注释的读写及 TMA 标记处理。
系统要求- 硬件:支持 AVX2 的 4 核 CPU(Intel Haswell 或 AMD Zen),4 GB 内存,1.0 GB 可用磁盘空间。
- 操作系统:最低要求 Windows 10 Pro(64 位)或 Windows Server 2019(64 位)。
- 网络:最低带宽 1 Gb/s;切片远程存储时建议 10 Gb/s 以获得最佳性能。
- 性能:每个 CPU 线程支持约 8 个切片;打开的切片每个约占用 100 MB 内存。
- 软件:Windows Server 托管需 Microsoft .NET 8.0;Microsoft Visual C++ 2015-2022 Redistributable (x64)。
备注在与 SlideCenter/SlideStorageDX 集成或将接口部署在远程主机时,高网络带宽为关键因素。接口在打开切片时会缓存图像和属性数据,这会影响内存使用量。
技术规格- 接口类型:类 REST API
- 主要集成:SlideCenter、SlideStorageDX、本地切片存储库
- 开发者支持:Python 示例、Jupyter Notebook 示例
- 注释格式:GeoJSON(读取/插入/删除)
- 瓷砖检索限制(免费):1000 瓷砖/秒(64 兆像素/秒)
- 原始相机 FOV 检索:可用(需许可)
- 每切片内存使用:打开时约 100 MB
- CPU 要求:4 核并支持 AVX2;每个 CPU 线程支持 8 个切片
- 最小内存:4 GB
- 最小磁盘:1.0 GB 可用
- 最小网络带宽:1 Gb/s(建议 10 Gb/s)
- 所需运行时:Microsoft .NET 8.0(用于 Windows Server 托管)