HLA单分子测序软件模块 SEQNEXT-HLA

实验室分析染色体图谱绘制

SEQNEXT-HLA是一个功能强大、用户友好的应用程序，用于分析来自所有常见的下一代测序平台和试剂盒的基于HLA序列的分型数据。所有的IMGT HLA数据库版本均可下载和导入。为了计算结果，内含子序列可以被视为排除空等位基因，此外还可以检查相位。 覆盖率和背景的警告可以被显示出来。新的等位基因也可以被调用。结果可以以最大、1个字段或2个字段的分辨率和NMPD代码的形式显示。所有的结果数据可以转移到实验室内部的LIM系统和/或作为个性化的病人报告发布。 与所有常见的下一代测序平台和试剂盒的数据兼容 基于IMGT HLA数据库轻松设置单个目标区域（ROI）。 分析fastq-或fastq.gz-文件 绘图、比对、质量和等位基因调用的高效标准 可配置的等位基因调用设置 分析完整的基因座（外显子和内含子数据）。 检测/排除基于内含子序列的空等位基因 阶段性检查以消除含糊之处 检测新的等位基因