医用软件 LD1

用于 LAMP设计共享

自动避免同源和模板结构 本地和桌面 BLAST 选项 自动序列检索 序列视图 引物计算器 数据和数据库管理 生成报告 关于 LAMP Designer OptiGene 提供一种软件应用程序，用于设计环路介导等温扩增（LAMP）检测的高效引物。LAMP 是由日本 Eiken 化学有限公司发明的一种 DNA 等温扩增方法，可在 30 分钟内将几个拷贝的 DNA 扩增到 109 个拷贝。 反转录耦合 LAMP 也可用于扩增 RNA 序列。LAMP 采用了六种专门设计的引物，可识别目标 DNA 中的八个不同区域，这六种引物的设计对于检测的成功至关重要。 LAMP Designer 可直接从 GenBank 等在线资源中检索成批的基因序列。该程序可执行 BLAST 搜索，以避免在设计引物时出现交叉同源性。它还支持本地和桌面 BLAST 选项，可使用自定义和未发布的数据库。 LAMP Designer 具有序列视图，可在序列上标注引物，并利用近邻热力学理论和高精度的 SantaLucia 值计算熔化温度 Tm。 该软件还能导出所设计测定的出版质量报告，以便与同事共享。数据以项目格式组织，并维护一个包含序列信息和搜索结果的本地数据库。 避免交叉同源 LAMP Designer 可自动解释 BLAST 搜索结果